أنشئت كلية الشريعة في جامعة الزرقاء عام 1994م؛ انطلاقاً من فلسفة الجامعة، ورسالتها، التي ترتكز على العقيدة الإسلامية، وتقوم على مفاهيم العلم، والإيمان، والأخلاق، والعمل، والتعاون، وتضم قسمي الفقه وأصوله، وأصول الدين. وتضم الكلية (9) أعضاء هيئة تدريس، وقد عقدت الكلية خلال الأعوام السابقة عدة مؤتمرات دولية محكمة وأيام علمية.

أنشئت كلية الآداب عام 1994م، ونمت وتطورت كمًّا وكيفًا، حتى غدت من أهم كليات الجامعة وأكبرها، من حيث أعداد الطلبة والمدرسين والتخصصات الأكاديمية. وهي عضو مؤسس في جمعية كليات الآداب في الوطن العربي، المنبثقة عن اتحاد الجامعات العربية؛ التابع لجامعة الدول العربية وتضم الكلية بين حناياها ثلاثة أقسام: قسم اللغة العربية وآدابها، وقسم اللغة الإنجليزية وآدابها والترجمة، وقسم المتطلبات الجامعية..

انشأت كلية الإقتصاد والعلوم الإدارية مع تأسيس الجامعة عام 1994؛ لتكون أحد أعمدة الجامعة التي تسهم في تحقيق رسالتها العلمية، والاجتماعية، ورفد القطاعات المختلفة في المملكة وخارجها بكوادر بشرية مؤهلة ومدربة علمياً وعملياً في المجالات الادارية والاقتصادية المختلفة .

إيماناً من جامعة الزرقاء بأهمية كلية العلوم التربوية في خدمة المجتمعين الأردني والعربي على حد سواء أنشئت الكلية عام 1994 كإحدى الكليات الرئيسة في الجامعة، واستمرت في تطورها ونموها الدائمين حتى الوقت الحاضر، آخذة بعين الاعتبار الجودة في التدريس وتميزمخرجاتها من الطلبة.

أنشئت كلية الحقوق في جامعة الزرقاء مع نشأة الجامعة في عام (1994) وتمنح درجة البكالوريوس في الحقوق وتعقد الكلية مؤتمراً علمياً كلما اقتضى الأمر ويوماً علمياً تنظمه كل عام. وتسهم الكلية في تحقيق رسالتها العلمية والاجتماعية وتشكل رافداً للقطاعات المختلفة على المستويين الوطني والإقليمي بكوادر بشريةٍ مؤهلةٍ علمياً وعملياً تسهم في البناء والتطوير

تأسست كلية الفنون والتصميم عام 2010م، وافتتحت برعاية معالي وزير التعليم العالي والبحث العلمي عام 2011م، وتأتي فكرة تأسيسها في إطار التوسيع في البرامج التي تقدمها الجامعة تلبية؛ لاحتياجات المجتمع المحلي، والإقليمي، وفي تطوير القوى البشرية محليا وإقليميا من خلال إعداد متخصصين في مجالات الفنون، والتصميم، قادرين على القيام بأعباء التنمية المحلية، والإقليمية، إضافة إلى تطوير التعليم في مجالات الفنون، والتصميم، وضمان الجودة،

تأسست كلية الصحافة والإعلام في جامعة الزرقاء في الفصل الدراسي الثاني 2010-2011، كامتداد لقسم الصحافة والإعلام الذي أنشئ في بداية العام الدراسي 2010-2011، وجاء تحويل القسم إلى كلية منسجماً مع حاجات السوق الأردني والعربي، ومتطلباته للكفاءات الإعلامية المدربة والمواكبة للمستجدات العلمية والعملية في حقل الصحافة والإعلام.

دأت الكلية بقسم العلوم الحياتية الذي افتتح عام 1995م ثم تحول إلى كلية العلوم الطبية المساندة عام 1997م، حيث تضم قسماً واحداً هو قسم التحاليل الطبية، والكلية معتمدة اعتماداً عاماً وخاصاً. ويبلغ عدد طلبتها حوالي (280) طالب وطالبة من جنسيات عربية وغير عربية مختلفة مثل الفلسطينية والسورية والعراقية والكويتية

تأسست كلية التمريض في جامعة الزرقاء في عام 2006. وقد أنشأت تلبيةً للاحتياجات الوطنية لممرضين مؤهلين تأهيلا عاليا. لذلك، تم تعيين فريق من أعضاء هيئة التدريس و المدربين السريرين المؤهلين تأهيلا عاليا في التخصصات التمريضية المختلفة و الذين يتبنون أساليب التعلم والتقنيات المتقدمة في مجال تعليم التمريض. كما تم في العام 2017/2018

نشأت كلية الصيدلة في بداية الفصل الأول للعام الدراسي 2010-2011 م، لتكون بذلك ثالث كلية للعلوم الصحية في الجامعة بعد كلية العلوم الطبية المساندة وكلية التمريض، ولتزود محافظتي الزرقاء والمفرق بشكل خاص والسوق الأردني والعربي بشكل عام بصيادلة ذوي كفاءة عالية. بدأت الكلية ببرنامج لدرجة البكالوريس وبهيئة تدريسية مكونة من ستة أعضاء أشرفوا على تهيئة المختبرات التعليمية والصيدلية الافتراضية ومتحف النباتات الطبية، كما قاموا بإعداد مفردات البرنامج الدراسي، والمنهج الدراسي والدليل العملي.

عد كلية العلوم من أقدم كليات الجامعة حيث أُنشئت عام 1994م, لتكون صرحاً علمياً مميزاً يساهم بفاعلية في تحقيق رؤية الجامعة ورسالتها, وقد أصبحت تضم كلا من أَقسام الرياضيات, والفيزياء, إلى جانب وحدة المساقات الخدمية والتي تعد رافداً مهماً لكلية العلوم والكليات الأخرى لما توفره من مساقات علمية أساسية, وتسعى الكلية الى التوسع في برامج الدراسات العليا, حيث يوجد برنامجاً لدراسة الماجستير في قسم الرياضيات,

تأسست كلية تكنولوجيا المعلومات مع بداية نشأت الجامعة في العام 1994 وذلك تلبية لحاجة المجتمع الملحة للخريجين المؤهلين في التخصصات التكنولوجية المختلفة فقد عملت الكلية على إعداد كوادر علمية متخصصة في مجال تكنولوجيا المعلومات لرفد السوق العالمية بها. تضم الكلية خمسة أقسام أكاديمية وهي: علم الحاسوب،

لقد تم تأسيس كلية الهندسة التكنولوجيه في جامعة الزرقاء بهدف الاستجابة لمتطلبات التكنولوجيا الحديثة في عالمنا اليومي المتطور. ولقد تم إعداد وتطوير البرامج الأكاديمية المختلفة بالتشاور الوثيق مع مجموعة من أصحاب المهارات والخبرات العلمية والعملية على حد سواء لضمان تهيئة خريجين أكفاء قادرين على الاندماج في سوق العمل لمجابهة تحديات المستقبل فور تخرجهم. ولقد بدأت الدراسة في كلية الهندسة التكنولوجيه

من منطلق استراتيجية الجامعة بعيده المدى فقد تم فصل عمادة الدراسات العليا عن عمادة البحث العلمي في بداية العام الجامعي 2014/2015 حيث اصبحت عمادة مستقلة تشرف على برامج الماجستير الموجوده في الجامعة ومن مختلف التخصصات, ومن الجدير ذكره أن سياسة كلية الدراسات العليا العمل على توفير البيئة الملائمة بما يكفل تحقيق أفضل مستويات ممكنة من مخرجات برامج الدراسات العليا بحيث تحاكي المعايير العالمية,